تأسست الرابطة الأفريقية للسلطات الانتخابية (AAEA) بمبادرة تهدف إلى تعزيز الاحترافية لدى السلطات الانتخابية الأفريقية من خلال التبادلات الإقليمية وبناء الشبكات. وقد تأسست الرابطة في أعقاب ندوة للسلطات الانتخابية الأفريقية عُقدت في فيكتوريا فولز، زيمبابوي، في نوفمبر 1994. وفي ختام هذا الاجتماع، شكّل المشاركون فريق عمل مكلفًا بدراسة جدوى إنشاء رابطة تضم المسؤولين الانتخابيين الأفارقة والمنظمات غير الحكومية الناشطة في المجال الانتخابي.
وقد أعدت مجموعة العمل مسودة ميثاق وناقشتها خلال اجتماع عُقد في كيب تاون عام 1995، ثم في ويندهوك عام 1996. وعُقد المؤتمر الافتتاحي الرابطة الأفريقية للهيئات الانتخابية (AAEA) في الفترة من 14 إلى 16 يناير 1997 في كمبالا، أوغندا. وقد جمع المؤتمر مسؤولين انتخابيين وقادة منظمات غير حكومية من أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى، بالإضافة إلى خبراء دوليين في مجال الانتخابات. وقام المشاركون بمراجعة الميثاق والموافقة عليه، مما شكل إيذاناً بالإنشاء الرسمي للرابطة.
عيّن المشاركون في اجتماع كمبالا الدكتور أماري تيكل، من إريتريا، أميناً تنفيذياً مؤقتاً الرابطة الأفريقية للهيئات الانتخابية (AAEA). وقد أُنشئ أمين عام تنفيذي مؤقت في أسمرة، إريتريا، في عام 1997. وعُقد الاجتماع الافتتاحي للجمعية العامة (AAEA) في الفترة من 13 إلى 15 أغسطس 1998 في أكرا، غانا. وشارك في هذا الاجتماع مسؤولون انتخابيون وقادة منظمات غير حكومية من أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى. وفيما يلي الدول الأعضاء المؤسسة للرابطة: بنين، بوركينا فاسو، جمهورية أفريقيا الوسطى، الغابون، غانا، غامبيا، غينيا، كينيا، ليسوتو، ليبيريا، مالي، السنغال، توغو، أوغندا، وزيمبابوي.
في ختام الجمعية العامة التي عُقدت في غانا في مارس 2025، انتخبت الرابطة الأفريقية للسلطات الانتخابية (AAEA) رئيسًا جديدًا للجمعية العامة للجمعية الأفريقية للسلطات الانتخابية (AAEA) بالإضافة إلى لجنة تنفيذية جديدة. وتتولى لجنة الانتخابات الغانية رئاسة الجمعية، وتدعم أعمال الجمعية لجنة تنفيذية تتألف من ممثلين عن لجان الانتخابات في بنين، وإثيوبيا، وجمهورية الكونغو الديمقراطية، وليبيا. يضمن هذا الهيكل الإداري التوازن الإقليمي والمشاركة الجماعية، مع ضمان التوجيه الاستراتيجي والإشراف على أنشطة الرابطة في جميع أنحاء القارة.